Se encuentra en el mismo lugar donde se fundó el antiguo convento de la Orden religiosa de los Franciscanos, en la Plaza de la Fuente Nueva. La Orden llegó a Martos en el siglo XVI y tuvo una importante repercusión en la población marteña. La parroquia que hoy conocemos se construyó en la década de los 70, años del s. XX. De la antigua iglesia se conserva la bella portada barroca de influencia colonial. Destaca la gran riqueza decorativa de su portada, que nos ofrece la talla de San Francisco de Asís, una rica labra de la piedra, con gran cantidad de motivos decorativos, geométricos, vegetales y figurativos, al igual que el rostro de un indiano.